### R code from vignette source 'GPA4fitstats.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: GPA4fitstats.Rnw:49-52 ################################################### library("GPArotation") data("GriffithMulaik", package = "GPArotation") n.obs <- 523 ################################################### ### code chunk number 2: GPA4fitstats.Rnw:64-73 ################################################### for (k in 3:8) { fa.k <- factanal(factors = k, covmat = GriffithMulaik, n.obs = n.obs, rotation = "none") res.k <- quartimax(fa.k) fit.k <- GPArotation:::calc_fitstats(res.k) cat(sprintf("k = %d RMSEA = %.4f [%.4f, %.4f] SRMR = %.4f\n", k, fit.k$RMSEA, fit.k$RMSEA.l, fit.k$RMSEA.u, fit.k$SRMR)) } ################################################### ### code chunk number 3: GPA4fitstats.Rnw:139-156 ################################################### fa.un <- factanal(factors = 6, covmat = GriffithMulaik, n.obs = n.obs, rotation = "none") res.vm <- Varimax(fa.un) res.ob <- oblimin(fa.un, randomStarts = 100) res.t1 <- tandemI(fa.un) fit.vm <- GPArotation:::calc_fitstats(res.vm) fit.ob <- GPArotation:::calc_fitstats(res.ob) fit.t1 <- GPArotation:::calc_fitstats(res.t1) cat(sprintf("Varimax SRMR = %.4f RMSEA = %.4f\n", fit.vm$SRMR, fit.vm$RMSEA)) cat(sprintf("Oblimin SRMR = %.4f RMSEA = %.4f\n", fit.ob$SRMR, fit.ob$RMSEA)) cat(sprintf("TandemI SRMR = %.4f RMSEA = %.4f\n", fit.t1$SRMR, fit.t1$RMSEA)) ################################################### ### code chunk number 4: GPA4fitstats.Rnw:166-167 ################################################### GPArotation:::audit_residuals(res.ob) ################################################### ### code chunk number 5: GPA4fitstats.Rnw:178-179 ################################################### plot(res.ob, "residuals") ################################################### ### code chunk number 6: GPA4fitstats.Rnw:205-206 ################################################### print(res.ob) ################################################### ### code chunk number 7: GPA4fitstats.Rnw:215-216 ################################################### summary(res.ob) ################################################### ### code chunk number 8: GPA4fitstats.Rnw:229-245 ################################################### res.gm <- geominQ(fa.un, randomStarts = 100) auc.ob <- GPArotation:::calc_AUC(res.ob)$AUC_mean auc.vm <- GPArotation:::calc_AUC(res.vm)$AUC_mean auc.gm <- GPArotation:::calc_AUC(res.gm)$AUC_mean hp.ob <- GPArotation:::calc_hyperplane(res.ob)$HP_pct hp.vm <- GPArotation:::calc_hyperplane(res.vm)$HP_pct hp.gm <- GPArotation:::calc_hyperplane(res.gm)$HP_pct cat(sprintf("%-12s AUC = %.3f Hyperplane = %.1f pct\n", "Varimax", auc.vm, hp.vm)) cat(sprintf("%-12s AUC = %.3f Hyperplane = %.1f pct\n", "Oblimin", auc.ob, hp.ob)) cat(sprintf("%-12s AUC = %.3f Hyperplane = %.1f pct\n", "GeominQ", auc.gm, hp.gm)) ################################################### ### code chunk number 9: GPA4fitstats.Rnw:256-263 ################################################### sim.un <- GPArotation:::calc_simplicity(fa.un) sim.ob <- GPArotation:::calc_simplicity(res.ob) cat(sprintf("%-12s Hoffman = %.3f Gini = %.3f Bentler = %.3f\n", "Unrotated", sim.un$Hoffman, sim.un$Gini, sim.un$Bentler)) cat(sprintf("%-12s Hoffman = %.3f Gini = %.3f Bentler = %.3f\n", "Oblimin", sim.ob$Hoffman, sim.ob$Gini, sim.ob$Bentler))